Arrivé en 1949 au sein du club bordelais, Michel Dupeux accompagna son coéquipier amateur des Coqs Rouges, le gardien Jean-Guy Astresses. Habitué à fréquenter les vestiaires de l'équipe réserve, il figure néanmoins parmi les joueurs présents dans l'effectif qui amena le premier titre de champion de France des Girondins en 1950.

Il fit par la suite de rares apparitions en Première division. Relégué le plus souvent en CFA, il décrocha le titre de champion de France amateurs en 1953.