Né à Nantes, Jérémy Toulalan signa sa première licence à la Saint-Pierre-de-Nantes, petit club de la Cité des ducs. Epoustouflant dès son plus jeune âge, il ne tarda pas à rejoindre le FCN. Il y grimpa toutes les marches vers l'équipe première. A 18 ans, il débuta en Ligue 1 en mars 2002. Il s'imposa rapidement dans le milieu de terrain nantais.
Après 6 saisons chez les professionnels, il s'engagea avec l'Olympique Lyonnais en 2006. Il découvrit la même année l'équipe de France. Avec le club rhodanien, il décrocha deux titres de champion de France et une Coupe de France. Mais le traumatisme de la Coupe du Monde 2010 et de Knysna plombèrent sa fin de carrière. En 2011, il quitta la France pour rejoindre la Liga et Malaga. Au bout de deux saisons, il revint en Ligue 1 à Monaco.
En fin de contrat, après 3 ans en Principauté, il s'engagea avec les Girondins. Séduit par le discours de Jocelyn Gourvennec, il devint un de ses relais sur le terrain et un des principaux artisans de la belle saison des Bordelais. Devenu capitaine des Girondins, il débuta la saison 2017-2018 avec le statut d'homme-fort de l'entraîneur. Repositionné en défense centrale, il ne parvint pas à insuffler une dynamique positive.
Lorsqu'en janvier 2018 Gourvennec fut licencié après une énième défaite à domicile contre Caen, Toulalan claqua la porte des Girondins et prit dans la foulée sa retraite sportive.
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